Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DffaO54786 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms