Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms