Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Atf6bO35451 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Atf6bO35451 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms