Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Casq1O09165 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Casq1O09165 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Casq1O09165 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Casq1O09165 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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