Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MttpO08601 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms