Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8857L7N291 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8857L7N291 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms