Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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