Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2888K7N746 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms