Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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