Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gm20828J3KMI7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm20828J3KMI7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm20828J3KMI7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm20828J3KMI7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm20828J3KMI7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm20828J3KMI7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm20828J3KMI7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms