Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Srp72F8VQC1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srp72F8VQC1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms