Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rarres1F6ZIS7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms