Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms