Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms