Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms