Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfbr3lD3YZZ2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms