Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Phf11bB4XVQ1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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