Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms