Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr29B1ARI9 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms