Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms