Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms