Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Prdm16A2A935 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prdm16A2A935 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prdm16A2A935 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms