Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pramef6A2A8M8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pramef6A2A8M8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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