Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprfA2A8L5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprfA2A8L5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprfA2A8L5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprfA2A8L5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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