Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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