Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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