Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Col4a3Q9QZS0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Col4a3Q9QZS0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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