Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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