Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc2lQ9JME7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms