Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rabgef1Q9JM13 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rabgef1Q9JM13 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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