Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms