Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Mrpl39Q9JKF7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Mrpl39Q9JKF7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Mrpl39Q9JKF7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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