Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tuba8Q9JJZ2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tuba8Q9JJZ2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tuba8Q9JJZ2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tuba8Q9JJZ2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tuba8Q9JJZ2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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