Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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