Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms