Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1dQ9DC28 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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