Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms