Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms