Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Jam3Q9D8B7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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