Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmigd1Q9D7L8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms