Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ttc9bQ9D6E4 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ttc9bQ9D6E4 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ttc9bQ9D6E4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ttc9bQ9D6E4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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