Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms