Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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