Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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