Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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