Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms