Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q9CRC3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms