Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms