Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms