Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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